en çok benzeyen konformasyonlar belirlemek için görece farklılıkları kullanarak virgülle ayrılmış veri dosyaları karşılaştırmak için Komut satırı aracı. Compsort, bağıl farkı kullanarak veri dosyalarını karşılaştıran bir benzerlik puan hesaplar, (düşük değerler daha benzerlik temsil) artan sırayla puanları sıralar, düşük puanları X sayısını kaydeder.
Kullanıcı tarafından üretilen veri dosyaları, ayrılmış metin dosyalarını virgülle gerekir. Her dosya eşsiz bir molekülü temsil eder. Bir dosyada her satır molekülünün benzersiz bir yapıyı temsil etmektedir. veri dosyasının ilk sütun satır ile temsil edilen yapı için benzersiz bir etiket olmalıdır. Sütunların kalanı gibi mesafe alanı ölçümleri gibi sayısal tanımlayıcılar vardır.
satır kombinasyon yöntemiyle dosyaları arasında karşılaştırılmıştır. karşılaştırıldığında etiketler birleştirilmiş ve satır kümesi için puanları ile kaydedilir. Bu belirli bir benzerlik puanı üretilen konformasyonlar tanımlamak için bir yol sağlar.
Gelecekteki çalışmalar içerir:
- ekleyerek GUI arayüzü
- benim 3D modelleme farmakofor algoritması kağıdı gönderme
- MPI kullanarak paralel versiyon
Bu sürümdeki yeni nedir:
- Bir çift küçük derleyici uyarılarını sabit
- Daha önce bildirilen sıralama zamanına ek olarak kombinasyon hesaplamaların seti için hesaplama süresi raporlama ekledi
- ikili artan derleyici optimizasyon seviyesi
Gereksinimler :
Mac OS X 10.3
Yorum Bulunamadı