GenoSuite proteogenomic analizi için geliştirilmiş bir çerçevedir. FDRScore tabanlı strateji birden fazla arama algoritmaları sonuçları entegre etmek için kullanılır. Prokaryotik Proteogenomic Aracı (PPT) GenoSuite çerçevesinin bir parçası olarak geliştirilmiştir. PPT prokaryotik genomlarında yeni çeviriler bulmak için ve Kütle Spektrometri göre proteomik verileri ve ilgili genom sekansı bağlıdır. Özellikler peptid tanımlanması ve seçilebilir 4 algoritmanın herhangi bir kombinasyonu için arama veritabanı gerçekleştirmek için 4 açık kaynak algoritmaları için yapılandırılmış içerir, genom arama belirli peptidler (Roman peptitler) dışarı listeler, spektral maçlar, dışarı listeler kalite değerlendirmesi için görsel olabilir yeni proteinleri ve mevcut protein açıklamalarla değişiklikler ve yeni peptitler görsel genomik içerik de üretilebilir.
Yorum Bulunamadı