Yazılım ekran görüntüsü:
Yazılım detaylar:
MISO (izoformlannın Karışım) ifadesi seviyesini & nbsp quantitates Python ile yazılmış bir olasılık çerçeve RNA-Seq verileri alternatif olarak eklenmiş genlerin ve numuneler arasında farklı şekilde düzenlenmiş izoformlarını veya eksonları tanımlar.
RNA-Sek izoformlarından üretilen okur tarafından üretken süreç modelleme, MISO modeli okuma belirli bir izoformu kökenli olasılığını hesaplamak için Bayes çıkarsama kullanır.
MISO alternatif mRNA izoformları altında yatan kümesinin zengindi ölçmek için izoformlarına okur türetilmiş atama kullanır. Tahminler üzerinden Güven aralıkları tahmin güvenilirliğini ölçmek, hangi elde edilebilir.
MISO kılavuzu ve dokümantasyon için http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ bakın
Gereksinimler :.
- Python
Yorum Bulunamadı