PANAMA Python ile yazılmış eQTL çalışmalarında, karıştırıcı faktörlerin hesaba yeni bir olasılık modeli.
Böyle gözlenmeyen değişkenlere veya bilinmeyen ince çevresel tedirginlikler olarak gizli karıştırıcı faktörler, sahte sahte dernek oluşturmak veya gerçek genetik dernek sinyallerini maskeleyebilir. Önceki yöntemlerin tersine, Panama birlikte belirgin genetik regülatörlerin etkisiyle gizli faktörleri öğrenir. Sonuç olarak, bu yeni model daha doğru karıştırıcı varyasyon gelen gerçek genetik dernek sinyalleri ayırt edebilir.
N. Fusi, O. Stegle ve ND Lawrence, 2012, PLoS Computational Biology "karıştırıcı faktörler ve belirgin genetik düzenleyiciler Ortak modelleme artan genetik genomik çalışmalar doğruluğu sağlar"
Daha Fazla Bilgi http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html
Requirements:
- Python
Yorum Bulunamadı