Pathomx

Pathomx (eski MetaPath) görselleştirme ve GNU / Linux ve diğer POSIX & nbsp altında metabolik verilerin analizi için interaktif bir programı olarak hareket sıfırdan tasarlanmış ipython, Qt ve PyQt'de uygulanan bir açık kaynak grafik yazılım, olduğu; işletme sistemleri. Başlangıçta ithal ve NMR normalleştirme, binning ve hizalama gibi metabolik yolu görselleştirme ve madencilik de dahil olmak üzere (Nükleer Manyetik Rezonans) veri spektrumları işleme, ihracat için destek içerir bir glanceKey özelliklere metabolomiks data.Features işlemek için kullanılmak üzere tasarlanmış edildi. Ayrıca belirtilen yollar üzerindeki görselleştirme için çeşitli yollardan genomik ve metabolomiks veri almak mümkün olacak.
Çeşitli MetaCyc veritabanı açıklamaları da biz veritabanı birleşme bağlantıları, eş anlamlı, hem de ilgili yollar ve tepkileri sayabiliriz aralarında Pathomx uygulamasında, dahildir. MetaCyc veritabanı kamu API türetilmiştir lütfen unutmayın.
Uygulama hızlı karmaşık veri kümelerinin keşif, uzayabilen sayesinde ve yapılandırılabilir eklentilerin güçlü MetaCyc veritabanını kullanır. Buna ek olarak, bu Matplotlib grafik için, NMR verileri ithalat için nmrglue, etkileşimli grafikler için d3.js, taşıma sayısı Numpy ve Scipy kütüphaneleri kullanır, ve istatistiksel analiz methods.Under kaput için scikit öğrenmek ve kaputunun altında OSesLooking desteklenen Pathomx, biz uygulama ipython komut kabuğu üzerine inşa edilmiş olduğunu fark edebilirsiniz. Aynı zamanda önceden oluşturulmuş ikili paketler olarak indirmek için kullanılabilir olduğu için, Microsoft Windows ve Mac OS X işletim sistemleri altında çalışır. GNU / Linux için yazılım sadece 32-bit ve 64-bit donanım platformları ile uyumlu bir gzip'li kaynak arşivi olarak dağıtılır.
Pathomx kullanırken, kullanıcıların uygulama BioCyc ailesinin bir parçası olan MetaCyc yolu veritabanının kendisi, veri kullanımını yapar akılda tutmalı. MetaCyc API yerel olarak saklanır verilen veritabanını oluşturmak için kullanılan

Bu sürümde Yeni nedir:.

• Tamamen yeni bir sürükle-bırak görsel editörü eklendi.
• Bu, çalışma alanına araçları sürükleyerek araçları arasında veri hatları sürükleyerek bağlantıları düzenleme ve mevcut işleme bir bakış elde etmek satır içi görünümleri kullanarak analiz iş akışları oluşturmak için olanak sağlar.
• Veri anlık ithalat için çalışma alanına düşmüş olabilir.
• Aynı zamanda başına araç bildirimleri, barlar, ve durum göstergeleri ilerleme canlı ekledi.
• Hatalar yardım metni ile işaretlenir (araçları ipuçları kırmızı belirtilen zaman).

Gereksinimler :

• Graphviz