SPInDel workbench

Yazılım ekran görüntüsü:
SPInDel workbench
Yazılım detaylar:
Versiyon: 1.0.1
Qayıt: 27 May 15
Geliştirici: GEPO
Lisans: Ücretsiz
Popülerlik: 6
Boyut: 19934 Kb

Rating: 1.0/5 (Total Votes: 1)

Iğ ribozomal RNA (rRNA) gen bölgeleri süresine bağlı olarak, biyolojik tanımlaması için alternatif bir yaklaşım. Genel olarak, farklı türlerden birincil rRNA gen dizilerinin saflaşma, hem nükleotid değiştirmelerin açısından (genellikle "SNP" olarak adlandırılır) ve ekleme / silme (Indel) olayları nükleotid korunması ve değişim alternatif bölgeleri göstermektedir. "-" farklı uzunluklarda dizileri indeller sonuçların varlığı ve tipik bir çizgi ile gösterilen uyum boşluklar, tanıtır.
Örneğin korunmuş bölgeler şu değişken bölümleri dizisinin bir kombinasyonu her tür (a "iğ profili") karakteristik uzunlukları olan ("iğ hiperdeğişken bölgeler") tanımlamak için kullanılır: aşağıdaki gibi biyolojik tanımlanması için Bizim kavramı rRNA gen dizilerini kullanmaktadır. Bu durumda, her bir tür benzersiz bir sayısal profili tarafından tanımlanabilir.
Teoride, 20 allel her (veya 5 allelleri her biri 11 bölgeler) ile sadece 6 Hiperdeğişken bölgelerin anket sayısı 5 milyon ila 15 olacağı tahmin edilmektedir yeryüzündeki tüm ökaryotik türler, ayrımcılık için yeterlidir. Uygulamada, iğ düşük tür içi varyasyon ve yüksek filogenetik çözünürlüğe sahip ökaryotik türlerin 93.3% ayırt edebiliyor.

Desteklenen işletim sistemleri

Benzer yazılım

Yorumlar SPInDel workbench

Yorum Bulunamadı
Yorum eklemek
Görüntülerde açın!