Insan genomları ve transcriptomes ve karakterizasyonu sorgulama, ölçeklenebilir sonuçlar veritabanı ve yönetmek için bir kullanıcı-dostu web tabanlı yazılım uygulaması ile birlikte;
kapsid kapsamlı bir açık kaynak patojen dizisi tanımlama & nbsp için yüksek performanslı hesaplama boru hattı entegre platform ve sonuçları görselleştirme.
Başlarken
Sen, bir Python 2.6+ kurulum ve Apache Tomcat 6 + bir MongoDB veritabanı gerekir. Daha fazla bilgi için, wiki okudu:
- Düzeltmeler: http://wiki.github.com/capsid/capsid/home
What Bu sürümde yeni Hata mesajı çıkarma ve uyum çalışıyor bulunamadı
- Uzun süren sorguları gidermek fazla çalışma
nedir sürüm 1.4.2 Yeni:
- kaldırır MongoKit bağımlılık
nedir sürüm 1.4.1 Yeni:
- Uzun çalışma istatistikleri sorguları için Düzeltmeler imleç zaman aşımı
nedir sürüm 1.4.0 Yeni:
- hepsi yerine koşmak edilirken ekler istatistikleri sonunda
- uid gibi genler için benzersiz kimliği kaydeder
sürüm 1.2.7 yeni nedir:
- Düzeltmeler README
nedir sürüm 1.2.6 Yeni:
Çıkarma eşlenen bina yaparken bağlanılmayan
sürüm 1.2 yeni nedir:
- bağlanılmayan okur gelen fastq dosyaları oluşturmak için Yardımcı
- Yardımcı fastq dosyalarının kavşak dönmek için
- Yardımcı filtre fastq dosyaları geri dönmek için
- Added mapq eşik bayrak için çıkarma
- Gbloader şimdi bakteri ve mantar genomları yükleyebilirsiniz
- GridFS kullanarak veritabanına genom dizileri kaydeder
- Düşük bellek izi istatistiklerini hesaplarken
- kullanım subprocesses yerine os.system ve
- mapq puanları filtre 0 içermesi gerekir
nedir sürüm 1.1 Yeni:
- çifti sonu için destek okur ekler
sürüm 1.0.1 yeni nedir:
- MongoDB kimlik doğrulaması için destek eklendi
Gereksinimler :
- Python
Yorum Bulunamadı