BioRuby

BioRuby Biyoinformatik için tümleşik bir ortam (Biyoloji Bilgi bilimi) sağlar.
S, web hizmeti de dahil olmak üzere kütüphaneler geniş bir yelpazede vb; Nesne yönelimli programlama dili Ruby biyoinformatik araştırma için uygun birçok özellik, örneğin, net sözdizimi olarak Perl gibi güçlü & rsquo karmaşık nesneleri, metin işleme için düzenli ifadeler ifade etmek vardır
Ruby sözdizimi basit ve çok temiz olduğu için, biz yazılım geliştiriciler için, yeni başlayanlar için öğrenmesi kolay biyologlar için kullanımı kolay ve aynı zamanda yeterince güçlü olduğuna inanıyorum.
BioRuby, geliştirici düz dosyalar, internet web sunucuları ve yerel ilişkisel veritabanlarından biyolojik veritabanı girdilerini alabilirsiniz.
Bu veritabanı girdileri ihtiyaç duyduğunuz bilgileri ayıklamak için çözümlenebilir. Biyolojik diziler Ruby & rsquo doyurucu yöntemlerle tedavi edilebilir; s String sınıfı ve düzenli ifadelerle.
Kütüphane Blast, Fasta, HMMER ve biyolojik analiz için diğer pek çok yazılım paketleri gibi araçlarla entegre edilebilir.
 BioRuby önemli biyolojik veritabanı formatlarını destekler ve flatfile indeksleme, SQL, web hizmetleri, vb KEGG API dahil olmak üzere çeşitli web hizmetleri kolayca BioRuby tarafından kullanılabilir onları erişmek için birçok yol sunar.

Özellikler :

• BioRuby shell
• API
• Belgeler

Gereksinimleri

• Ruby 1.8.7 veya daha yüksek