FlexS diğerine göre ligandların bir şeklini ve yönünü öngörür. FlexS içinde referans ligandı bu nedenle, bağlı duruma benzer bir yapı içinde verilmelidir, katı olduğu tahmin edilmektedir. FlexS süperpozisyon algoritması sadece küçük manuel müdahale gerektirir. El tek adımları yaparak FlexS ile hesaplamaları içine bu bilgiyi entegre edebilirsiniz. Bu nedenle, FlexS bağ çiftleri olarak ligand-esaslı sanal tarama için etkileşimli çalışmak için tasarlanmıştır. FlexS iki ana uygulama ligand süper konumlandırma (örn. CoMFA / QSAR için) ve sanal tarama. Bir protein ve buna bağlanan küçük bir molekül (sözde referans ligandı), ancak, proteinin hiç bir yapıya sahip ise, aktif sitenin negatif parmak izi olarak bir referans yapısı sunar. FlexS onları hizalayarak test ve referans yapısı arasındaki benzerlik belirler. Sanal tarama, bir referans-ligand ve bileşiklerin bir dizi var ve deneysel testleri için bileşikler öncelik ilgilendi.
Yorum Bulunamadı