Arabidopsis Motif Tarayıcı (AMS) yerel bilgisayar üzerinde çalışan bir Windows uygulamasıdır. Bu model bitki Arabidopsis thaliana cis-düzenleyici elemanların konumlarını belirleyerek değerlendirmek ve gen ilişkileri değerlendirmek için kolay bir arayüzü sağlayarak gen ağları oluşturmak için geliştirilmiştir. En önemli yeni özelliği cis-düzenleyici element pozisyonları birleştirmektir, NGS ve DNA Chip Diziler ekspresyon verileri, Arabidopsis ek açıklamalar ve transkripsiyon faktörleri ile düzenlenen gen ağlarının tanımlanması için gen etkileşimi. transkripsiyon faktörleri fonksiyonu üzerinde duruldu çalışmalarda, yazılım ifade verileri kullanır ve düzenleyici gen bölgelerinde sitesi motiflerini bağlayıcı doğrudan hedef genleri tahmin etmek. Buna ek olarak, AMS ilgi transkripsiyon faktörü ile düzenlenen metabolik yolların tanımlanmasını kolaylaştırmak için, DNA-protein, proteinprotein etkileşim verileri kullanır.
Yorum Bulunamadı