MacVector, dizi düzenleme, primer tasarımı, internet veritabanı araştırması, protein analizi, sekans doğrulama, çoklu dizi hizalama, filogenetik rekonstrüksiyon, kodlama bölgesi analizi ve çok çeşitli diğer işlevleri sağlayan kapsamlı bir Macintosh uygulamasıdır. MacVector, dizi analizi için kullanılabilir en sezgisel, kullanımı kolay bir program olarak kabul edilir.
Bu sürümde yeni :
Dairesel dizilerin son kalanında başlayan hizalama okunduğunda Referansa Hizala ile ilgili bazı küçük sorunlar düzeltildi.
16.0.6 sürümünde yeni :
Dairesel dizilerin son kalanında başlayan hizalama okunduğunda Referansa Hizala ile ilgili bazı küçük sorunlar giderildi.
16.0.2 sürümünde yeni :
OS X 10.7 ve OS X 10.8'de Referans Ekle Sekanslarını Hizala işlevini çağırırken bir kilitlenme giderildi .
Bir diziyi GenBank biçiminde dışa aktardığınızda, MacVector şu anda kullanılmamış olsa bile tüm GenBank özelliklerini yazmaktadır.
15.5.4 sürümünde yeni :
Kısıtlama Enzimi çift sindirim çıktı, yalnızca iki veya üç enzim seçildiğinde beklendiği gibi çalışır.
15.1.4 sürümünde yeni :
Tek sıralı düzenleyicideki 3/6 çerçeve çevirisi artık çerçeveyi doğru şekilde koruyor
bir çizgi sonrası.
Referansa Hizalama Düzenleyicisi'ndeki 3/6 çerçeve çevirisini açarken bir çökme
65.000'den fazla kalıntı dizisi düzeltildi.
15.1.3 sürümünde yeni nedir:
Birden Çok Sıralı Hizalama Düzenleyicisi'ndeki bir hata düzeltildi . Bu hatanın etkisi, zaman zaman kaydedildiklerinde dizilerin başında ek artıkların ortaya çıkmasıydı. Bu sadece düzenlenmiş MSA belgelerini etkiledi. Sadece ClustalW / Muscle / T-Coffee ile hizalanmış ve düzenleme yapılmadan kaydedilmişse, hizalamalar doğru olacaktır.
15.1.1 sürümünde yeni :
Düzenlenmiş bir Çoklu Sıralama Hizalaması kaydederken kilitleniyor
(.msan, .msap) belgeleri çözümlendi.
Bazı fastq okumalarının bir Klasöre Hizala arama sonucundan birden çok kez yazılacağı bir hata düzeltildi.
14.5.3 sürümünde yeni :
Klasöre Hizala işlevinde arada sırada bir kilitlenme giderildi.
Primerler çiftleri test edildiğinde nadir bir çökme düzeltildi
Yeni olan nedir 14.5.2 sürümünde:
Klasöre Hizala şimdi aramaları doğru bir şekilde kullanarak dairesel orijini geçen bir dizinin segmenti.
Harita Tercihleri'nde "Otomatik Yeniden Aramanın Otomatik Olarak Açılması" nın açılması / kapatılması artık tüm açık pencereleri doğru şekilde günceller.
14.0 sürümünde yeni :
Büyük diziler ve hizalamalar ile çalışırken performans artışının yanı sıra, primer kullanımında (primer veritabanları için destek dahil) ve NGS verisinde önemli gelişmeler vardır.
13.5.5 sürümündeki yeni :
"????" türündeki özelliklerin bulunduğu bir sorun Kayıtlı bir Align To Reference (.axml) dosyası açıldığında oluşturulur.
13.5.3 sürümündeki yeni :
- Contig Editor ekranı, kaydedilen hizalamayı yüklerken şimdi OS X 10.6'da doğru şekilde yenileniyor.
- Protein Analysis Toolbox'ta bir kilitlenme düzeltildi.
- Çok sayıda kısıtlama enzimi ile çalışırken Quicktest Primer arabiriminde bir kilitlenme giderildi.
13.5.2 sürümündeki yeni :
Contig Editor / Reference to Reference Editor'da kaydırma sorunu giderildi. Farklı bir ağda uyandığında nadir bir kaza düzeltildi.
13.5.1 sürümündeki yeni :
- OS X 10.6'da, içe aktarılan sekanslar artık orijinal dosya adlarını korur.
- Kaydedilmemiş sekansları kapatarak ara sıra çarpışmalar düzeltildi.
- Açıklamalı metin çıktısındaki çeviriler artık tercih bayraklarını onurlandırmaktadır.
- "Adsız" sekansların numaralandırılmasında bazı tutarsızlıklar çözüldü.
- OS X 10.6'da sıralama pencerelerinin kaybolacağı bir sorun var,
- Referansa Hizala düzenleyicisindeki birkaç ekran hatası düzeltildi.
- Kalıntı seviyesine yakınlaştırıldığında Harita sekmesinde bazen çevirilerin eksik olduğu bir sorun.
- BAM dosyalarını bir Assembler Projesi'ne alma yeteneği geri yüklendi.
- Nükleik asit çoklu hizalama belgelerinin artık kendi renk gruplarına ve engelleme varsayılanlarına sahip.
- Primer Design'ın "Test PCR Primer Pair" modunda bulunan primerler artık 35 nt uzunluğunda olabilir.
- Metin görünümleri artık tek bir sayfaya yazdırmak için genişlik olarak otomatik olarak yeniden boyutlandırılır.
13.5 sürümünde yeni :
Grafik Simge Editörü ve yüzer Grafik Paleti, MacVector için 64 bit mimariye (MacVector 14.0 nedeniyle) taşınmaya hazırlık olarak yeniden yazılmıştır. Diğer ana geliştirmeler, Yeni Nesil Dizileme (NGS) dosyalarının, özellikle Klasöre Hizala ve Montajcı Kadife de novo montaj işlevselliği ile daha iyi ele alınmasını amaçlamıştır. Ayrıca, büyük genomik dizilerin analizini daha iyi ele almak için bazı kod optimizasyonları olmuştur, özellikle Pustell Matrix "nokta-çizim" işlevselliği ile dikkat çekmektedir.
Yorum Bulunamadı