RAPTOR

RAPTOR doğru protein yapı tahmini için tasarlanmış yenilikçi bir yazılımdır. Bu bir entegre yazılım çözümü gelişmiş analiz araçları birleştirir ve üç farklı diş yöntemleri sağlar. RAPTOR'un benzersiz tamsayı programlama optimizasyon yaklaşımı düşük dizisi homoloji ile hedeflerin yapısı şablonları bulmak için en etkili ve kaliteli modellerini üretebilir. kolay kullanımlı arayüzü ve E değerleri yeni başlayanlar ve uzmanlar için ideal olan kolay anlaşılır. Her şeyden önce, çıkış sezgisel ekran basit bir bakışta sonuçlarını anlamak için olanak sağlar. Bilinen 3B yapısına sahip bir homolog protein olduğu takdirde, bir hedef protein dizisi göz önüne alındığında, aynı zamanda Raptor Resim PSI-BLAST gibi dizi arama araçları kullanılarak bulunabilir. Hedefin yapı, daha sonra bilinen yapıdan inşa edilmiştir; sekans benzerliği önemli değildir ancak, daha az% 25, ​​PSI-BLAST kendine güvenen hit ile gelip olamaz yani. Basit bir dizi arama yapar PSI-BLAST, protein parçacığı, tanıma kat aksine, hem homoloji ve yapı bilgisi kullanır. Bilinen yapıların bir veri tabanına karşı, bilinmeyen bir yapısı olan protein sekansı tarar. Bir puanlama fonksiyonu kullanılarak ve üç boyutlu yapılar ve lineer protein dizileri arasındaki uyumluluk analizi yapılarak, en iyi yapısal şablon dizisi yapısını inşa etmek için olan tespit edilecektir. Sonuç olarak, protein parçacığı marjinal dizisi homoloji olduğu homoloji modellemesi daha üstün bir tahmin verir

Sınırlamalar :.

Sınırlı işlevsellik