MACS2 ChIP-Seq veriler için bir model tabanlı analiz aracıdır.
Sıralama tekniklerinin geliştirilmesi ile, kromatin immunoprecipitation yüksek verimlilik sıralaması takip (ChIP-Seq) genom protein-DNA etkileşimleri incelemek için popüler oluyor. Güçlü ChIP-Seq analiz yöntemi eksikliği gidermek için, biz bağlanma yerleri transkript faktörü tanımlamak için ChIP-Seq (MACS) Model-tabanlı Analiz adında yeni bir algoritma, sunuyoruz. MACS zenginleştirilmiş ChIP bölgelerin önemini değerlendirmek için genom karmaşıklık etkisini yakalar ve MACS sıralama etiketi pozisyon ve yönelim hem de bilgi birleştirerek bağlanma yerlerinin uzaysal çözünürlüğü artırır. . MACS kolayca yalnız ChIP-Seq verileri için kullanılan, ya da özgüllüğü artması ile kontrol numunesi ile olabilir
Gereksinimler :
- Python
Yorum Bulunamadı