Staden Paketi DNA dizisi montaj (boşluk4), düzenleme ve Unix, Linux, MacOSX ve MS Windows için analiz araçları (Spin) bir tamamen gelişmiş kümesidir.
Boşluk4 cephesinde ilgili birleştirme birkaç küçük olmuştur
nasıl skorlarında iyileşme İç Katıldı ve Find birleşimler
Üyelik Düzenleyicisi'nde hizalama düğmenin işlevi.
Ayrıca boşluk4 için sonucun (io_lib çeşitli değişiklikler
Çeşitli izleme dosyası formatları tüm G / Ç için kütüphane). Eklenmesiyle
Deney dosyalar için yeni hash_exp programı Hemen sağlar
birlikte birleştirilmiş ve endeksli. Deney dosya adları listesi
Halen boşluk4 verilen, ancak EXP_PATH ortamı sağlanmalıdır
doğru ayarlanmış olan değişken bireysel almak mümkün olacak boşluk4
birleştirilmiş deney dosyasının dışına dizileri
arşiv. Bunun için kullanıcı arayüzü geliştirmeleri hala olması gerekir
yapılmıştır.
454 SFF arşivleri şimdi daha iyi desteklenir. defsult 454 endeksleri
hash_sff programı sağlamak için kullanılabilir, ancak artık, iş
Alternatif indeksleme stratejisi (muhtemelen daha hızlı bazı durumlarda).
Boşluk4 ve Trev da izleri başka iz ekran stili var olduğunu
Baz arama başına 1 numune tarama (x4 kanalları) vardır. Bu durumda can
Ayrıca 4 güven değerlerini yerine tabanı başına 1 çizin. Bu yetiler
Solexa ve sağlayacak daha iyi entegrasyon zaman daha kolay izleri
Mevcut.
Artı tabii hata düzeltmeleri ve küçük tweaks olağan karışımı. Görmek
(SourceForge sitesi üzerinden) Detaylar için tam bir değişiklik günlüğü.
Diğer önemli değişiklikler
Boşluk4
Yorum Bulunamadı