Biyoinformatik Benchmark Sistemi, makul bir test çerçevesi testleri ve veri oluşturmak için kendi sistemlerinin performansını incelemek için son kullanıcıların ve satıcıları sağlamak için bir girişimdir.
Ne yapmaya çalışıyoruz test için bir çerçeve ve tüm indirmek ve sistem performansının belirli öğeleri incelemek için kullanabilirsiniz testler bir çekirdek kümesi oluşturmak için olduğunu.
Dahası, bu testlerin kaynak GPL mevcuttur ve fikri kolayca ölçüm ve ayar nedeniyle anlamlı testler oluşturmak ve kullanmak için son kullanıcıları, tüketicileri, sistem geliştiriciler ve diğerleri sağlamaktır Bioinformatics.org ve Ölçeklenebilir Bilişim LLC barındırılan .
Ölçeklenebilir Bilişim LLC Joe Landman fikri tasarlanmış ve orijinal kodları yazdı. Biz vb ek gösterge kod önerileri, testler, veri setleri, arıyoruz
Güncel bazal testleri, birkaç NCBI BLAST çalışan birkaç HMMER çalışır, ve diğerleri bir çeşitlilik vardır. Biz ClustalW X! Tandem, çeşitli kimya, dinamikleri ve ilgili testler, yanı sıra çok sayıda diğerleri sayılabilir planlıyoruz.
Böyle LINPACK veya HPL olarak Testler sadece yüksek performanslı bilişim için anlamlı performans göstergeleri veya akıllı modelleri vermeyin. Ne yazık ki, ne daha yeni ve odaklanmış bir dizi test yapmak.
Bu özellikle etkili normal bellek erişimi desenleri ve belirli matematiksel işlemler var çeşitli matris işlemleri, performansı test etmek LINPACK ve HPL olarak bir sorundur.
Bu kodlar, ağır kayan nokta operasyonları ile kodlarına göre ve Interleaved bellek trafiği için çok yararlıdır. Bu kodlar, disk I / O, bellek gecikme ve diğer faktörler tüm performans sorunları katkıda kapsamlı sistem kıyaslama için tasarlanmamıştır.
En iyi testler makinede çalışacak kodları en benzer olanlardır. Testler kendilerini gerçek verileri kullanarak kod gerçek bir infaz makul yaklaşımlar olmalıdır. Gerçekçi çalışma sürelerini almak için geri pare gerekebilir.
Veri boyutları makul bir alt kümesi olmalıdır. Tek bir sınav sistemi ölçekler nasıl size değil, ve bu testin özendirdiği için nedenlerinden biri size iş yükünü çeşitli yönlerini artırmak yaparken performansını test etmek için özel olarak olduğunu.
Nadiren bir kümede bir sessiz sistem olsun, yani mümkün olduğunca gerçekçi bir işletim ortamında çalıştırmayı denediğinizde biz öneriyoruz. Bir durgun sistemindeki bir temel para cezası, ama makul beklentileri ayarlayabilirsiniz.
üst
Yorum Bulunamadı