CWC Simulator

.

CWC Simülatörü C ++ CWC, temsil ve biyolojik sistemlerin simülasyonu & nbsp bir hesabın uygulamasıdır; başarılı bir kurulum (INSTALL bakın) sonra bazı örneklerde gösterildiği gibi, CWC modeller üzerinde simülasyonlar çalıştırmak mümkün olacak (/ örneklere bakın).
(komut satırı) Arayüz
Genel kullanıcı olarak, koşmak gerekir:

-i model.cwc
-o
-t
-s
-n <çalışır>
-c
--qt eşik
q
-w
Nerede:
- olan yürütülebilir adı (varsayılan: scwc);
& Nbsp; - model.cwc girişi CWC programı (örneklere bakın) 'dir;
& Nbsp; - istatistik çıkış dosyaları öneki;
& Nbsp; - simülasyon zaman sınırı yoktur;
& Nbsp; - (zaman sınırı = 30 ile 250 puan almak için yani 0.12) örnekleme dönemi;
& Nbsp; - <çalışır> simülasyon örnekleri sayısıdır;
& Nbsp; - k araçları için kümelerin sayısı
& Nbsp; - QT kümeleme için eşik
& Nbsp; - quantiles sayısıdır;
& Nbsp; - sisteminizin çekirdek sayısını eşleştirmek için genellikle vardır (yani 4 dört çekirdekli işlemci için).
Çıktı
aracı oluşturur:
- Bazı .dat dosyaları (simülasyonlar örneklenen çıkışı)
- Bazı gnuplot komut dosyaları istatistiksel analizlerle çizmek için
Biz kapsamlı bir kullanım kılavuzu ile çalışıyoruz

Özellikler :.

• CWC modeller üzerinde Gillespie SSA algoritması
• Hibrid stokastik / deterministik semantik
• çevrimiçi istatistikleri ile simülasyon birden çok örneği
• FastFlow çerçeveye dayalı çok çekirdekli mimarileri için Optimizasyon
• Genişletilebilir istatistiksel çerçeve (ortalama-varyans, kümeleme, vb süzülür.)
• Birden değerlendirme semantik (kütle aksiyon, Michaelis-Menten Hill vb.)