Yeni Biyoinformatik Için Linux
ADIMLAR keyfi karmaşık 3D geometrileri reaksiyon-difüzyon sistemleri tam stokastik simülasyon için bir pakettir. Bizim temel simülasyon algoritması Gillespie SSA bir uygulamasıdır, bir 3D tetrahedral mesh elemanları üzerinde moleküllerin difüzyon ile başa...
NEO (Sinir Ensemble Nesneler) ve birlikte daha yakın benzer hedefleri olan OpenElectrophy, NeuroTools ve belki diğer projeler alma amacıyla, nöral veri analizinde kullanılacak temel sınıflar ortak bir dizi sağlamak için bir projedir.İki büyük hedefler...
OpenElectrophy manipülasyon, depolama ve elektrofizyolojik verilerin analizini kolaylaştırmak için bir çerçevedir. Birçok farklı dosya formatları veri almak ve tek bir SQL tipi veritabanında saklayabilirsiniz.OpenELectrophy dahil Analiz araçları salınım...
PEAT, yakalama tahmin ve proteinlerin biyofiziksel özelliklerini analiz programları bir takımdır.Dokümantasyon, talimatlar, ekran vb http://enzyme.ucd.ie/PEAT bakın Gereksinimler :. ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) gibi insan genomunun gibi uzun bir referans dizisi karşı nispeten kısa nükleotid dizileri hizalar verimli bir program.Yazılım iki algoritmaları, bwa kısa ve BWA-SW uygular. Sorgu için eski eserler 200 bp'lik daha kısa ve...
. SSuMMo takson dizileri atamak için HMMER kullanarak etrafında iteratif tasarlanmış fonksiyonlar & nbsp bir kütüphane, Sonuçlar bu topluluk içinde türler / cins dağılımını gösteren son derece açıklamalı ağaçlar.Kaynak kodu ile birlikte Programlar...
kayabalığı ikili veri dosyalarını okumak için bir Python API Goby nesil veri yönetimi çerçevesi kullanılarak oluşturulmuş olduğunu.Normalde, bu dizin komple Goby paketinin bir parçası, hazır olarak geliyor:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/komple paket...
PySCeS Moleküler Hücre Fizyolojisi & nbsp Üçlü-J Grubu tarafından geliştirilen bir projedir;. Modeli denemek ve yaşam hücresini oluşturan karmaşık süreçleri ve sistemleri anlamak için Özellikler :. Bir metin tabanlı bir model tanımlama dili ...
. Pysam okuma ve Samfiles manipüle & nbsp için bir Python modülü; Bu samtools C-API hafif sarıcı var.hızlı başlangıç kılavuzu burada. Daha ayrıntılı belgeler burada bulabilirsiniz.Sorular ve yorumlar çok hoş ve...
. TRMiner bir Python bilimsel veriler küratörler amaçlayan programı & nbsp olduğu; hızla belirli bir maden gol hakkında cümleler bilimsel yayınların büyük koleksiyonları budamak için izin verir.Bu iki basamakta elde edilir. Birincisi, metinler, ilgili...